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正确认识新冠病毒核酸检测“假阴性”
发布时间: 2020-03-11 11:07:13

  冠状病毒属于套式病毒目、冠状病毒科、冠状病毒属,是一类具有囊膜、基因组为线性单股正链的RNA病毒,可分为α、β、γ、δ四个属。2020年1月世界卫生组织(WHO)命名引发此次疫情的冠状病毒为2019-nCoV,中文名称是“2019新型冠状病毒”,分类学属于冠状病毒β属,是目前已知的第7种可以感染人的冠状病毒。
  一、不同方法学的诊断性能
  1. IgM与IgG检测
  IgM是机体感染后产生的早期抗体,提示现阶段被感染的状态;而IgG则提示存在既往感染史。但是无论是IgM还是IgG,从病毒感染到抗体产生均存在窗口期,因此其检测往往滞后于核酸检测,在检测敏感度上也低于核酸检测。
  2. CT检测 
  CT检测必须在肺部已经产生炎症反应、引起组织器官发生器质性病变的情况下才能在影像学上呈现异常,而此时患者有可能已经向外界传播了大量病毒,因此CT检测在当前疫情防控极为紧迫的情况下具有一定的滞后性。
  3. 病毒RNA检测
  核酸检测是能最早确诊新型冠状病毒感染的方法,一是因为此时患者尚处于疾病的早期阶段,尽早检测对于疫情防控具有重要作用;二是核酸检测可以定量检测病毒的拷贝数,进而动态监测病毒感染的程度和治疗的效果。
  二、但当前新型冠状病毒核酸检测存在一定的假阴性,其原因可能是:
  1.快速审批,缺少足够的临床验证
  在我国,核酸检测试剂正常情况下开发完成后,需经过临床试验确认结果的有效性后,再由国家药品监督管理局审批才能正式上市。但目前由于新型冠状病毒疫情的紧迫性,国家药品监督管理局启动应急审批程序,仅4d就批准了4种新型冠状病毒检测试剂上市,紧急应对当前疫情。
  2.大样本病毒基因组研究及临床验证的缺失
  目前大多数新型冠状病毒检测试剂都是靶向新型冠状病毒的特定区域,通过RT-PCR扩增病毒的ORF1ab基因和N基因等进行荧光定量检测。然而,新型冠状病毒属于RNA病毒,很不稳定,容易产生变异。而在目前的情况下,试剂开发企业很难得到大规模临床样本进行试剂盒开发和临床验证。这就导致在试剂开发设计中只能根据有限的公开数据进行引物设计,但对大样本中的实际情况缺乏了解,只能在临床一线用了再说。
  3.临床采样导致的误差
  病毒性肺炎患者在下呼吸道具有更高的病毒载量,所以下呼吸道分泌物的检出率会更高一些,但获取肺泡灌洗液等下呼吸道样本操作上要求较高,且易喷溅,传播风险高,比较耗时。在各种核酸检测样本采样中,鼻、咽拭子是最常用的采样方式,但是这类样本的病毒核酸检出率与病毒感染进程密切相关。尤其是该病潜伏期长,绝大多数患者就诊时可能已经迁延了数天至数周,是否是鼻、咽拭子检测的最佳时期,样本内病毒载量是否仍然在方法学的检测范围内还有待确定。
  4.样本运输的限制
  各种RNA病毒的核酸由于自降解和生物酶介导的降解,是最难以稳定保存的生物分子之一。含有RNA病毒的样本建议存放于专用的病毒保存液中,且必须在冷藏状态下(即4 ℃或更低温度)保存并尽快运输送检。然而目前绝大多数医院在样本采集后,及时性及冷藏性均不能完全保证。
  五、试剂缺乏监控核酸提取质量的内标以及样本间、样本内重复
  目前的检测试剂大多仅针对核酸提取后的检测,而对于RNA提取的方法以及质量未做明确说明;加入到体系内扩增的样本量也通常以体积而非RNA量来约定,这可能导致不同方法学提取的RNA质量良莠不齐、从而影响到最终的扩增效果。
  总之,新型冠状病毒与其他致病性的RNA病毒类似,感染机体后,病毒的遗传物质RNA是最先能被检测到的标志物,对于疫情的防控有重要意义。

 


遗传室  杨鹏

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